内蒙古库都尔河湿地公园位于内蒙古大兴安岭重点国有林管理局库都尔林业局局址西南部，紧邻库都尔镇。地理坐标介于东经121°23′49″~121°35′54 ，北纬49°56′39″~50°2′11″ 之间，北起实验站管护所79林班10小班，南至原林管护所60林班2小班，东起爱林管护所，西达原林管护所54林班1小班，总面积5775.5hm2，其中湿地面积为31.9hm2，湿地率67.39%。

湿地公园内主要水体为库都尔河，库都尔河由东向西贯穿湿地公园，园内河长19.4km。